Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms