Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCN1BQ07699 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms