Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNB3Q05901 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms