Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
OTUD4Q01804 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
OTUD4Q01804 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms