Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IFITM3Q01628 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFITM3Q01628 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFITM3Q01628 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms