Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITPNAQ00169 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PITPNAQ00169 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms