Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATP2C1P98194 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP2C1P98194 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms