Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SKOR1P84550 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SKOR1P84550 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms