Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VBP1P61758 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms