Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB10P61026 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB10P61026 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB10P61026 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB10P61026 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms