Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNAP25P60880 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms