Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms