Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COPAP53621 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
COPAP53621 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COPAP53621 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPAP53621 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPAP53621 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms