Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NESP48681 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NESP48681 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NESP48681 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NESP48681 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NESP48681 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NESP48681 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NESP48681 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NESP48681 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NESP48681 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NESP48681 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NESP48681 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NESP48681 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NESP48681 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms