Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRB2P47870 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRB2P47870 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms