Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRATP43155 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRATP43155 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CRATP43155 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms