Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCCP43146 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCCP43146 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DCCP43146 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCCP43146 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms