Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA9P31269 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms