Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF1P22415 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF1P22415 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF1P22415 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF1P22415 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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