Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms