Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACADSP16219 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ACADSP16219 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ACADSP16219 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ACADSP16219 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms