Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-9P01782 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms