Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2O43734 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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