Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SMAD6O43541 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMAD6O43541 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms