Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MTSS1O43312 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTSS1O43312 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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