Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBXN8O00124 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms