Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PATL2C9JE40 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PATL2C9JE40 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms