Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF879B4DU55 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms