Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PIAS3Q9Y6X2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIAS3Q9Y6X2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIAS3Q9Y6X2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PIAS3Q9Y6X2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms