Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y698

CACNG2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG2Q9Y698 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNG2Q9Y698 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG2Q9Y698 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms