Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD54BQ9Y620 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms