Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.3 ms