Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRAPPC4Q9Y296 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms