Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMG5Q9UPR3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms