Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FOXD3Q9UJU5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms