Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CMTM6Q9NX76 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms