Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCM2LQ9NUG4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCM2LQ9NUG4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCM2LQ9NUG4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms