Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP35Q9NRY4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP35Q9NRY4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP35Q9NRY4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP35Q9NRY4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP35Q9NRY4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP35Q9NRY4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARHGAP35Q9NRY4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP35Q9NRY4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms