Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRN4Q9NRL3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms