Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

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Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZNF407Q9C0G0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF407Q9C0G0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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