Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CEP44Q9C0F1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms