Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM54Q9BYV2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms