Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms