Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP2Q9BX26 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms