Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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IFT27Q9BW83 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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IFT27Q9BW83 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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IFT27Q9BW83 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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IFT27Q9BW83 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFT27Q9BW83 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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