Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms