Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNS3Q9BQ31 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms