Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOPXQ9BPY8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms