Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITX2Q99697 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms