Protein–RNA interactions for Protein: Q99551

MTERF1, Transcription termination factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF1Q99551 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF1Q99551 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF1Q99551 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms